More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2769 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  100 
 
 
304 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  46.05 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  45.54 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  45.54 
 
 
318 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  46.2 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.77 
 
 
310 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  45.72 
 
 
318 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.95 
 
 
324 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.36 
 
 
322 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  47.67 
 
 
321 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  43.93 
 
 
309 aa  225  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  47.67 
 
 
321 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1890  agmatinase  43.61 
 
 
315 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0474276 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  42.53 
 
 
306 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  43.51 
 
 
319 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  43.22 
 
 
317 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  42.12 
 
 
309 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  44.82 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  46.95 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  44.2 
 
 
324 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  44.82 
 
 
320 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  45.45 
 
 
316 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  44.48 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  46.45 
 
 
306 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  46.72 
 
 
334 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  43.69 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  40.84 
 
 
319 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  46.89 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  43.77 
 
 
306 aa  215  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  46.1 
 
 
306 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  45.74 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  45.74 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  45.54 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.5 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.5 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  47.64 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  41.67 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  47.64 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  45.9 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  43.81 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  46.32 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.74 
 
 
333 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  41.37 
 
 
310 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  41.25 
 
 
320 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  43.57 
 
 
321 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  41.53 
 
 
309 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  41.25 
 
 
320 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  44.4 
 
 
316 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  41.23 
 
 
307 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  41.18 
 
 
322 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  41.25 
 
 
320 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  43.42 
 
 
322 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  45.23 
 
 
321 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  41.25 
 
 
316 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  44.52 
 
 
321 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  43.09 
 
 
322 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  41.5 
 
 
354 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  43.09 
 
 
322 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  42.67 
 
 
325 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  46.83 
 
 
311 aa  208  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.48 
 
 
324 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  43.09 
 
 
325 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  43.79 
 
 
317 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  41.72 
 
 
315 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  39.55 
 
 
306 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  42.33 
 
 
316 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.86 
 
 
329 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.81 
 
 
326 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.81 
 
 
326 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.81 
 
 
326 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.63 
 
 
321 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  43.42 
 
 
322 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  41.88 
 
 
356 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  44.22 
 
 
330 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  40.91 
 
 
320 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  41.58 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.53 
 
 
315 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  42.11 
 
 
342 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  42.43 
 
 
322 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  40.58 
 
 
315 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  41.12 
 
 
378 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  43.88 
 
 
315 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  46.83 
 
 
322 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.47 
 
 
315 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.8 
 
 
321 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  42.55 
 
 
315 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  41.39 
 
 
317 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  40.51 
 
 
351 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  41.94 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>