More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3420 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  99.67 
 
 		 306 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  99.67 
 
 		 306 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  100 
 
 		 306 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  99.67 
 
 		 306 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  99.67 
 
 		 306 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  97.39 
 
 		 306 aa  603  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  97.39 
 
 		 306 aa  603  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  97.39 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  97.39 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  97.71 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  86.18 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  62.58 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  63.25 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  61.89 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  60.98 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  61.44 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  61.24 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  60.98 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  60.33 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  56.04 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  55.51 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  55.51 
 
 		 321 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  55.51 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.55 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  52.75 
 
 		 322 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  49.5 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  49.5 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  49.5 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  48.37 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  48.37 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  50.7 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  49.17 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  52.06 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  48.04 
 
 		 320 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  49.32 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  48.5 
 
 		 322 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  50.94 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  47.21 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  46.69 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  42.33 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  45.89 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  45.79 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  43.15 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  46.84 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  44.61 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  45.03 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  46.45 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  40.79 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  44.69 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  40.33 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  45.02 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  44.31 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  45.99 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  42 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  45.42 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  45.42 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  45.42 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  41.55 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.9 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  43.3 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.53 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.35 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.24 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  42.26 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.89 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  41.83 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.95 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.36 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  40 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  41.02 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  39.3 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  39.8 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  41.02 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  41.36 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.52 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.14 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  42.72 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.13 
 
 		 378 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  42.66 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  41.75 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.49 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  39.34 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.55 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.55 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.05 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.55 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  40.8 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  40.8 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  40.8 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  40.99 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  42 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.26 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  40.82 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>