More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0860 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  100 
 
 		 318 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  77.6 
 
 		 316 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  77.29 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  78.23 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  77.07 
 
 		 317 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  76.97 
 
 		 316 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  73.82 
 
 		 315 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  77.32 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  56.39 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  55.7 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  55.37 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  55.37 
 
 		 321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  54.43 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  52.38 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  52.13 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  51.32 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  51.66 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  51.97 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  51.66 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  50.64 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  51.64 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  50.32 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  50.32 
 
 		 320 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  50.99 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  50.79 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  50.52 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  46.69 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  50.66 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  53.12 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  48.43 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  44.55 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  46.79 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  47.39 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  45.97 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  45.83 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  46.15 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  44.67 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  43.23 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  45.32 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  43.23 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  45.19 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  40.92 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  45.11 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  44.24 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  44.61 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  43.87 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  41.58 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.32 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  42.14 
 
 		 315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.13 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  40.26 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.33 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  39.34 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.87 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.52 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  39.43 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  38.12 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  39.3 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  40 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.07 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.07 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.07 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.29 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  39.46 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  44.24 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.21 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  39.87 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  40.33 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.67 
 
 		 354 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.25 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  37.58 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.25 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.25 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  39.34 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  37.42 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  36.1 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.24 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  36.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  37.87 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  38.8 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  37.67 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  38.8 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  38.8 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  38.29 
 
 		 316 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  40.58 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  37.29 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  37.18 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  39.46 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>