More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2340 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  100 
 
 
321 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  69.69 
 
 
321 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  69.69 
 
 
321 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  70.31 
 
 
321 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  67.5 
 
 
324 aa  424  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  63.72 
 
 
342 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  57.23 
 
 
320 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  55.27 
 
 
322 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  55.31 
 
 
321 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  55.31 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  54.95 
 
 
321 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  52.73 
 
 
319 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  55.88 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  55.88 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  55.56 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  54.58 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  51.45 
 
 
315 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  53.92 
 
 
322 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  53.92 
 
 
322 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  53.92 
 
 
322 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  50.79 
 
 
318 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  53.59 
 
 
322 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  54.58 
 
 
320 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  50.64 
 
 
320 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  50.64 
 
 
320 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  53.27 
 
 
322 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  53.47 
 
 
325 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  49.84 
 
 
317 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.16 
 
 
316 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  50.49 
 
 
316 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  53.59 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  51.12 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  46.13 
 
 
309 aa  255  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  49.83 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  46.46 
 
 
306 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  46.13 
 
 
306 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  44.19 
 
 
309 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  45.61 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  44.52 
 
 
307 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.56 
 
 
310 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  45.03 
 
 
321 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  45.79 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  45.08 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  46.53 
 
 
306 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  45.85 
 
 
306 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  46.18 
 
 
306 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  46.18 
 
 
306 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  45.94 
 
 
327 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  45.85 
 
 
306 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  45.76 
 
 
306 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  46.84 
 
 
320 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.95 
 
 
319 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.95 
 
 
319 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.95 
 
 
319 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.87 
 
 
316 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  42.91 
 
 
310 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  45.36 
 
 
324 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  43.24 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  43.58 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  44.04 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  43.42 
 
 
317 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.14 
 
 
329 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  44.3 
 
 
322 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.86 
 
 
324 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  42.76 
 
 
351 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  42.28 
 
 
354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  47.37 
 
 
345 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  43.09 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  43.75 
 
 
315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.43 
 
 
325 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.58 
 
 
334 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  45.75 
 
 
333 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  47.37 
 
 
369 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  43.09 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.95 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.95 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.95 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  43.09 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.1 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  42.44 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  41.2 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.92 
 
 
320 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.92 
 
 
320 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  42.9 
 
 
306 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  40.92 
 
 
316 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.92 
 
 
320 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.5 
 
 
319 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.24 
 
 
318 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  40.68 
 
 
316 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.94 
 
 
378 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>