More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2410 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  100 
 
 		 352 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  81.2 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  81.32 
 
 		 351 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  81.61 
 
 		 351 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  65.88 
 
 		 356 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  65.71 
 
 		 351 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  61.19 
 
 		 353 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  63.91 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  49.35 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  50.67 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  49.67 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  49.03 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  48.73 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  47.9 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  46.93 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  44.86 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.33 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  46.25 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.09 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.66 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  44.27 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  45.28 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  47.65 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.31 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  43.04 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  44.63 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.04 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  44.3 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.16 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.61 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.99 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  42.99 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  42.99 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  44.81 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.83 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  42.59 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.34 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  44.16 
 
 		 329 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  42.9 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  42.9 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  42.9 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  46.2 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  44.16 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  42.99 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  42.9 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  42.9 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  43.51 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  44.52 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  43.51 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  43 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  42.35 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  44.52 
 
 		 317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  42.02 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  42.35 
 
 		 329 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  42.02 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  42.02 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  42.02 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  42.59 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  38.56 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.45 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.93 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  38.24 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.9 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.9 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.9 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40.86 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.6 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.39 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  38.71 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  40.8 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.28 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  37.42 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42.29 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  42.29 
 
 		 321 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.51 
 
 		 321 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  42.24 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  43.09 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  38.16 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  42.24 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  42.24 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  41.25 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  40.19 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  41.67 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.58 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  38.56 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  38.06 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.93 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  38.83 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  44.28 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  40.92 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  39.87 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  39.87 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.53 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  39.87 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  40.59 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  38.24 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  39.74 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  43.01 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  37.34 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  39.41 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>