More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1433 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  100 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  77.47 
 
 		 324 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  78.91 
 
 		 318 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  75.8 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  73.63 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  73.63 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  73.63 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  68.81 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  69.16 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  64.61 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  64.87 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  63.96 
 
 		 378 aa  411  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  68.83 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  63.58 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  65.26 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  67.54 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  66.13 
 
 		 324 aa  394  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  64.08 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  62.75 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  62.83 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  62.75 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  61.64 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  62.83 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  62.83 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  62.75 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  61.64 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  59.15 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  59.15 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  59.15 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  50.81 
 
 		 317 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  48.18 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.85 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  47.52 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  45.77 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  45.93 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  47.85 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  48.87 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  46.73 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  46.53 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  46.53 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  46.53 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  46.53 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  47.71 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  46.53 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  47.85 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  49.84 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  47.57 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  47.52 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  47.52 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  47.85 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  46.1 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  47.23 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  47.52 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  46.41 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  47.52 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  46.41 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  47.19 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  46.18 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  44.81 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  47.52 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  48.15 
 
 		 306 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.86 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  46.1 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  49.03 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  45.54 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  45.25 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.13 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.54 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  50.53 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  45.34 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  44.44 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  46.3 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  46.3 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  42.77 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  43.04 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  43.73 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.95 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.05 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  43.95 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  42.17 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.27 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  41.83 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.62 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  43.12 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  42.81 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  43.18 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  40.94 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  43.59 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  43 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  46.67 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.294688 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  40.75 
 
 		 430 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  41.72 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  41.39 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  40.07 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  39.58 
 
 		 362 aa  215  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>