More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7678 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  100 
 
 		 334 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  89.22 
 
 		 334 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  70.15 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  69.55 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  70.9 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  57.23 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  61.15 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  55.84 
 
 		 324 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  60.83 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  59.81 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  56.47 
 
 		 322 aa  351  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  53.18 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  53.87 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  53.87 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  53.87 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  53.87 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  53.87 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  53.55 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  52.53 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  49.36 
 
 		 322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  50.78 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  49.84 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  51.13 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  50.47 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  49.52 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.25 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  48.74 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  49.84 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  49.2 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  47.57 
 
 		 316 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  48.57 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  51.32 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  48.87 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  47.66 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  48.55 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  47.66 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  48.87 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  48.87 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  47.91 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  46.2 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  49.03 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  46.6 
 
 		 316 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  46.6 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  46.28 
 
 		 320 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  46.28 
 
 		 320 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  46.77 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.95 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  46.77 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  45.45 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  48.72 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  47.76 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  48.26 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  47.94 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.01 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  49.01 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  45.45 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  45.51 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  45.57 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  45.09 
 
 		 352 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  49.46 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  45.25 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  44.87 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.51 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  45.57 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  45.71 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  46.33 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  49.65 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  42.27 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  44.23 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  43.27 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  43.4 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  42.59 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  43.4 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41.96 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  42.14 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  45.08 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  46.6 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  43.91 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  43.51 
 
 		 324 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  43.16 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.36 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.59 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.36 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.59 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.59 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.36 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.37 
 
 		 315 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  45.62 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.59 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.75 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  43.51 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.75 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  41.16 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  41.36 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  45.39 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  44.48 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  42.04 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>