More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4700 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  100 
 
 		 318 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  83.76 
 
 		 315 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  81.59 
 
 		 315 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  75 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  74.04 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  73.9 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  73.58 
 
 		 318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  73.58 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  73.27 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  73.95 
 
 		 329 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  73.58 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  73.58 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  70.38 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  70.83 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  70.38 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  74.28 
 
 		 342 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  71.79 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  70.7 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  72.96 
 
 		 329 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  71.11 
 
 		 319 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  71.11 
 
 		 319 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  70.51 
 
 		 316 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  70.16 
 
 		 319 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  70.19 
 
 		 322 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  72.99 
 
 		 319 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  70.68 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  72.03 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  73.31 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  72.03 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  67.53 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  68.42 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  63.78 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  50.97 
 
 		 322 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  49.68 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  50.33 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  48.87 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  49.35 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  49.03 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  48.39 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  46.77 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  49.34 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  46.89 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  46.89 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  46.71 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  47.44 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  48.38 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  46.13 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  49.34 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  49.34 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  47.91 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  45.95 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  47.23 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.17 
 
 		 345 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  45.93 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.86 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  48.39 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  45.95 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.93 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  46.73 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.28 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  46.75 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  46.75 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  46.75 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  44.59 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  45.75 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  46.05 
 
 		 326 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  46.05 
 
 		 326 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  46.05 
 
 		 326 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  44.23 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  46.8 
 
 		 317 aa  248  7e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  46.13 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.75 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.75 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.75 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  44.41 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  46.77 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  46.77 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  42.77 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  43.83 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  47.84 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  45.72 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  46.45 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  46.96 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  42.53 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  41.95 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  43.14 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  42.53 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  42.86 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  45.72 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  44.44 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  42.21 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  45.16 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  43.87 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  43.33 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  43.33 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>