More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6964 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6964  agmatinase  100 
 
 
334 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  89.22 
 
 
334 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  69.76 
 
 
345 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  69.16 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  70.99 
 
 
333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  56.92 
 
 
324 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  55.21 
 
 
324 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  58.23 
 
 
318 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  58.23 
 
 
318 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  57.46 
 
 
318 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  55.97 
 
 
322 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  53 
 
 
317 aa  318  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  53.92 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  53.92 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  53.92 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  53.92 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  53.92 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  53.61 
 
 
317 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  52.38 
 
 
319 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  49.52 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  51.13 
 
 
329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  51.13 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  48.73 
 
 
322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  49.84 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.25 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  48.87 
 
 
318 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  48.29 
 
 
354 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  48.29 
 
 
354 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  49.19 
 
 
310 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  48.55 
 
 
318 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.93 
 
 
316 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  48.23 
 
 
329 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  47.91 
 
 
318 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  48.11 
 
 
320 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  48.23 
 
 
318 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  48.22 
 
 
316 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  50.66 
 
 
306 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.94 
 
 
315 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  48.87 
 
 
315 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  45.89 
 
 
319 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  46.28 
 
 
320 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  46.28 
 
 
316 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.95 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.95 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  45.95 
 
 
319 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  48.39 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.63 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  45.95 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  46.43 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  45.51 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  46.15 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  46.35 
 
 
327 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  46.06 
 
 
317 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  45.51 
 
 
378 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  44.87 
 
 
354 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.34 
 
 
315 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  44.73 
 
 
325 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  45.66 
 
 
329 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  44.87 
 
 
324 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  43.71 
 
 
338 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  44.13 
 
 
321 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  44.55 
 
 
318 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  44.66 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  43.84 
 
 
351 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  46.71 
 
 
353 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  45.81 
 
 
311 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  41.96 
 
 
316 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  44.19 
 
 
351 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  42.59 
 
 
352 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  45.71 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  47.93 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  42.27 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  46.28 
 
 
315 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.88 
 
 
324 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.27 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.27 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.27 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.59 
 
 
320 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.07 
 
 
315 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.76 
 
 
319 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.76 
 
 
319 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  41.99 
 
 
351 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.76 
 
 
319 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.27 
 
 
320 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.59 
 
 
321 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  42.31 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.98 
 
 
324 aa  231  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  45.31 
 
 
320 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.7 
 
 
337 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  42.19 
 
 
310 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  41.23 
 
 
324 aa  230  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.26 
 
 
321 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  42.12 
 
 
322 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  46.83 
 
 
321 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  46.83 
 
 
321 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.77 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  46.48 
 
 
321 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>