More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4051 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  100 
 
 		 320 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  78.55 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  78.55 
 
 		 321 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  78.55 
 
 		 321 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  78.55 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  73.8 
 
 		 322 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  61.99 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  61.99 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  61.68 
 
 		 320 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  60.19 
 
 		 322 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  63.61 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  59.87 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  59.87 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  60.9 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  60.9 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  60.9 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  60.12 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  58.04 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  55.37 
 
 		 342 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  58.1 
 
 		 321 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  55.02 
 
 		 315 aa  351  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  57.23 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  56.39 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  58.1 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  54.49 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  54.17 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  59.2 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  58.86 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  53.72 
 
 		 316 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  54.72 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  52.1 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  52.9 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  53.24 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  51.69 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  54.87 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  55.04 
 
 		 307 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  55.04 
 
 		 306 aa  311  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  50.33 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  53.21 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  54.18 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  53.24 
 
 		 309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  54.24 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  54.55 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  54.55 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  54.55 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  54.55 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  54.55 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  53.82 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  53.82 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  51.85 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  54.18 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  53.45 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.93 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  44.62 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.41 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  44.81 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.3 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.48 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  44.16 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.55 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.64 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.97 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  44.34 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  45.97 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  45.57 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  43.96 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.54 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.54 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  46 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.06 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.64 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  45.64 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  44.37 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  44.22 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.24 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.24 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.24 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  45.54 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  45.72 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  43.23 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.23 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  43.23 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.23 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  44.77 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  44.77 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  44.77 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.33 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  42.72 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  43.85 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  42.24 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43.79 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  44 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>