More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2473 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  100 
 
 		 351 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  81.32 
 
 		 352 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  77.36 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  78.06 
 
 		 351 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  65.69 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  67.84 
 
 		 351 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  64.02 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  64.51 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  51 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  49.83 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  50 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  49.52 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  47.17 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  52.16 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  48.36 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  47.37 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  49.46 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  45.93 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  44.68 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.3 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.55 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43.65 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  43.87 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43.65 
 
 		 319 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.32 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  43.69 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  46.4 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  43.65 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.65 
 
 		 316 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  43.65 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.65 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  41.77 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.68 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  47.9 
 
 		 318 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  42.53 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  46.55 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  44.6 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  42.07 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  42.53 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  43.52 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  44.6 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  43.52 
 
 		 306 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  41.32 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  41.69 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  41.37 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  41.37 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  41.37 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  43.46 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  44.19 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  43.46 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  43.46 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  41.75 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.27 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  40.39 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  40.39 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  40.39 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.86 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  41.23 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  38.89 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.5 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.16 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  40 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  40.73 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  38.91 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.71 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.94 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.74 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  40.97 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  37.74 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  41.27 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  39.74 
 
 		 324 aa  212  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  42.33 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  41.42 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42.33 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  40.65 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.05 
 
 		 315 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.58 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  40.59 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  38.98 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  43.09 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.61 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  41.64 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  40.92 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  40.92 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.53 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  40.26 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.53 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.53 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  39.94 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  40.92 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.62 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.72 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  40.5 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  40.51 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  39.6 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>