More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2907 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  100 
 
 		 317 aa  634    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  59.94 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  57.78 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  60 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  55.95 
 
 		 324 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  58.92 
 
 		 313 aa  351  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  53.57 
 
 		 322 aa  328  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  54.07 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  53.75 
 
 		 320 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  51.78 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  51.45 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  50.96 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  52.12 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  51.78 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  51.78 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  51.78 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  50 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  52.9 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  52.1 
 
 		 315 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  51.15 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  51.8 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  50.65 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  51.82 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  50.65 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  50.65 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  49.02 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  47.57 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  49.19 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  48.37 
 
 		 378 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  49.19 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  48.53 
 
 		 354 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  48.53 
 
 		 354 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  48.86 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  48.38 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  49.38 
 
 		 322 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  51.8 
 
 		 317 aa  286  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  51.3 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  51.3 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  48.86 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  51.3 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  48.21 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  48.69 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  48.69 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  48.24 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.9 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.83 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  48.04 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  50.81 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  48.52 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  48.52 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  48.52 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  48.52 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  48.52 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  48.26 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  48.52 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  49.84 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  48.09 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  46.56 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  49.84 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  50.78 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  45.28 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.28 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.28 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  47.39 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  48.2 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  45.25 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  44.9 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  46.38 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  45.72 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  48.38 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  45.45 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  45.45 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.38 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  48.65 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  48.05 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  48.05 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.03 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.16 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  50.88 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  44.66 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  47.56 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  47.92 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  47.83 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  47.83 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  47.83 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  46.52 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  46.06 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  46.2 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  46.77 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  45.89 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  45.13 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.26 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  44.62 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  45.7 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  48.28 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  41.89 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  42.58 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  44.52 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  43.52 
 
 		 351 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  43.79 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>