More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4643 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  94.3 
 
 
351 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  100 
 
 
351 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  81.2 
 
 
352 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  77.36 
 
 
351 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  64.39 
 
 
356 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  64.22 
 
 
351 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  60.06 
 
 
353 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  62.04 
 
 
331 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  50.81 
 
 
316 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  48.82 
 
 
324 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  47.52 
 
 
333 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.81 
 
 
345 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  45.48 
 
 
369 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  46.05 
 
 
318 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  43.26 
 
 
324 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  44.63 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  44.74 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  43.97 
 
 
324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  43.69 
 
 
310 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.27 
 
 
334 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  44.48 
 
 
315 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  41.69 
 
 
319 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  43.32 
 
 
316 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  42.67 
 
 
319 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.67 
 
 
319 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  43.61 
 
 
322 aa  243  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  41.14 
 
 
316 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  42.09 
 
 
330 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  44.74 
 
 
318 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.19 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.19 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.19 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  42.53 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.19 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  41.37 
 
 
316 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.18 
 
 
320 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.88 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  40.69 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  40.19 
 
 
315 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  44.81 
 
 
322 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  41.37 
 
 
329 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  41.04 
 
 
318 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  40.13 
 
 
317 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  41.69 
 
 
318 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  41.04 
 
 
318 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  42.21 
 
 
315 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  40.58 
 
 
319 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  40.07 
 
 
354 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  40.07 
 
 
354 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  40.07 
 
 
318 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  42.19 
 
 
317 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  40.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  40.13 
 
 
317 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  40.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  40.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  40.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  40.13 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  38.89 
 
 
318 aa  220  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  39.37 
 
 
320 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  41.99 
 
 
334 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  40.46 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  40.9 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  37.74 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  38.59 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  40.47 
 
 
321 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  40.13 
 
 
321 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  39.5 
 
 
320 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  40.47 
 
 
321 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  41.25 
 
 
319 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  37.26 
 
 
315 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  35.82 
 
 
378 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  36.79 
 
 
354 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  38.49 
 
 
326 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  38.49 
 
 
326 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  38.49 
 
 
326 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  39.87 
 
 
325 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  39.61 
 
 
324 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  42.76 
 
 
321 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.1 
 
 
315 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  40.59 
 
 
320 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  40.59 
 
 
320 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  38.26 
 
 
318 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  40.59 
 
 
320 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.76 
 
 
321 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  39.6 
 
 
325 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  36.15 
 
 
342 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  36.51 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  37.94 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  38.14 
 
 
337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  36.5 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  39.16 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  38.49 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  39.27 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  38.99 
 
 
329 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  39.6 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  38.49 
 
 
320 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  39.67 
 
 
321 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>