More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2499 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  100 
 
 
316 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  94.62 
 
 
316 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  92.94 
 
 
293 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  76.97 
 
 
318 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  77.07 
 
 
315 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  77.46 
 
 
317 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  77 
 
 
320 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  76.36 
 
 
320 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  55.31 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  53.72 
 
 
320 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  54.05 
 
 
321 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  53.4 
 
 
321 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  53.72 
 
 
321 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  52.43 
 
 
319 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  51.29 
 
 
322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  51.78 
 
 
322 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  51.46 
 
 
322 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  51.46 
 
 
322 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  51.78 
 
 
322 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  51.46 
 
 
322 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  50.81 
 
 
320 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  50.49 
 
 
320 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  50.49 
 
 
320 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  50.49 
 
 
322 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  52.1 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  50.51 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  46.47 
 
 
342 aa  278  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  46.62 
 
 
324 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  53.07 
 
 
322 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  50.49 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  46.3 
 
 
321 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  46.5 
 
 
321 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  45.86 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  46.44 
 
 
306 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  45.08 
 
 
309 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  45.76 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  47.65 
 
 
309 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  45.96 
 
 
310 aa  245  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  44.12 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  45.82 
 
 
306 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  45.82 
 
 
306 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  42.86 
 
 
309 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  45.76 
 
 
307 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  45.42 
 
 
306 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  45.42 
 
 
306 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  45.79 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  39.94 
 
 
324 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  41.27 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  44.4 
 
 
304 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  38.26 
 
 
320 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.83 
 
 
317 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  41.23 
 
 
315 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  38.26 
 
 
320 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  40.2 
 
 
316 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  41.42 
 
 
329 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  40.53 
 
 
313 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.53 
 
 
320 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.8 
 
 
318 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.13 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.39 
 
 
315 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  41.38 
 
 
306 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  38.69 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  38.69 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  38.77 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  38.69 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.99 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.2 
 
 
321 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  38.94 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.14 
 
 
378 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.35 
 
 
317 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.53 
 
 
337 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  40.45 
 
 
334 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.87 
 
 
327 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  37.7 
 
 
321 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  41.64 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  37.95 
 
 
322 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  39.74 
 
 
345 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  39.74 
 
 
343 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  39.74 
 
 
343 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.17 
 
 
326 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  40.79 
 
 
345 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.16 
 
 
338 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.17 
 
 
326 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.17 
 
 
326 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.45 
 
 
315 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  38.51 
 
 
317 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  40.72 
 
 
369 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  38.83 
 
 
317 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>