More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32515 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  100 
 
 
440 aa  906    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  53.54 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  40.96 
 
 
412 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  43.06 
 
 
398 aa  290  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.49 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.49 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.49 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.74 
 
 
337 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.86 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.86 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.86 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.43 
 
 
321 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  39.24 
 
 
362 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43.4 
 
 
321 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  39.94 
 
 
315 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.81 
 
 
327 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.01 
 
 
329 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  40.25 
 
 
324 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.41 
 
 
313 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.41 
 
 
313 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.41 
 
 
313 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40 
 
 
315 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  42.57 
 
 
343 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  42.57 
 
 
345 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  42.57 
 
 
343 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07669  hypothetical arginase family protein (Eurofung)  37.11 
 
 
387 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.108652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  39.08 
 
 
320 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  39.01 
 
 
325 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  39.56 
 
 
354 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  38.12 
 
 
318 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  41.25 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.01 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  40.25 
 
 
324 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.01 
 
 
317 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  36.76 
 
 
338 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  38.77 
 
 
311 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  36.39 
 
 
321 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  36.09 
 
 
321 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  35.29 
 
 
333 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  36.09 
 
 
321 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  34.48 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  38.17 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  36.48 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  36.36 
 
 
322 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  34.38 
 
 
316 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  34.92 
 
 
305 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.06 
 
 
319 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  34.06 
 
 
315 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  36.48 
 
 
313 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  35.8 
 
 
324 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  34.06 
 
 
324 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  33.44 
 
 
315 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  35 
 
 
369 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  35.33 
 
 
345 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  36.16 
 
 
316 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  36.28 
 
 
342 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  34.69 
 
 
319 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  35.78 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  35 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33.03 
 
 
320 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  33.03 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33.03 
 
 
320 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  33.03 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  34.33 
 
 
330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  36.61 
 
 
322 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  36.39 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  35.42 
 
 
322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  35.19 
 
 
322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  35.19 
 
 
322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  34.67 
 
 
315 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  33.33 
 
 
318 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  36.15 
 
 
309 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  34.47 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  33.89 
 
 
329 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  33.64 
 
 
318 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  33.89 
 
 
342 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  34.8 
 
 
322 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  36.95 
 
 
307 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  33.64 
 
 
318 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  35.69 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  33.33 
 
 
318 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  33.64 
 
 
329 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  36.49 
 
 
306 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  32.82 
 
 
317 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  36.15 
 
 
309 aa  160  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  33.02 
 
 
354 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  33.02 
 
 
354 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  36.27 
 
 
306 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  36.27 
 
 
309 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33 
 
 
315 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  36.91 
 
 
321 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  33.33 
 
 
324 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  34.8 
 
 
322 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.19 
 
 
316 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  33.33 
 
 
320 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  34.45 
 
 
351 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.13 
 
 
319 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  36.28 
 
 
321 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  36.82 
 
 
306 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  31.83 
 
 
319 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>