More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5725 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  100 
 
 
346 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  63.84 
 
 
345 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  63.84 
 
 
345 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  63.84 
 
 
345 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  63.23 
 
 
340 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  65.4 
 
 
369 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  63.5 
 
 
354 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  63.83 
 
 
340 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  59.26 
 
 
378 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  47.85 
 
 
365 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  47.85 
 
 
365 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  47.85 
 
 
365 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  50.7 
 
 
333 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  48.87 
 
 
356 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  50.32 
 
 
478 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  48.38 
 
 
346 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  47.74 
 
 
321 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  38.51 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  38.51 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  36.07 
 
 
396 aa  198  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  38.19 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  38.19 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  37.86 
 
 
318 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  37.86 
 
 
318 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  38.39 
 
 
317 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  37.86 
 
 
329 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  34.86 
 
 
396 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  37.03 
 
 
315 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  38.31 
 
 
317 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  37.99 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  37.99 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  37.99 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  37.99 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  37.5 
 
 
305 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.11 
 
 
316 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  37.99 
 
 
317 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  37.04 
 
 
330 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  38.22 
 
 
319 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  35.76 
 
 
315 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.49 
 
 
321 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  36.42 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  36.51 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  36.75 
 
 
342 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.39 
 
 
322 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  36.51 
 
 
320 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  37.29 
 
 
320 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  36.18 
 
 
320 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.72 
 
 
319 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  36.18 
 
 
320 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.66 
 
 
310 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  36.39 
 
 
319 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  36.13 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  39.37 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  38.68 
 
 
345 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  37.87 
 
 
317 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  35.16 
 
 
316 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  38.11 
 
 
318 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  36.24 
 
 
324 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  38.82 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  37.54 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.52 
 
 
319 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  37.79 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  35.48 
 
 
319 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  35.48 
 
 
319 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  35.48 
 
 
319 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  37.15 
 
 
321 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  37.54 
 
 
320 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  38.64 
 
 
313 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  38.64 
 
 
313 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  38.64 
 
 
313 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.88 
 
 
326 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.88 
 
 
326 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  37.46 
 
 
337 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.88 
 
 
326 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  35.33 
 
 
316 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  36.42 
 
 
315 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  36.36 
 
 
329 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  36.99 
 
 
327 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  36.42 
 
 
306 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  36.6 
 
 
318 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  38.16 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  36.96 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  39.24 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  36.05 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  36.6 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  38.41 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  37.69 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.41 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  38.34 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  36.6 
 
 
324 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  36.3 
 
 
318 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.28 
 
 
382 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  36.18 
 
 
315 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  36.62 
 
 
324 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  34.6 
 
 
324 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  33.12 
 
 
416 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  38.76 
 
 
352 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  38.16 
 
 
351 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  37.86 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  37.3 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>