More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0938 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  100 
 
 		 1342 aa  2644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  45.67 
 
 		 756 aa  611  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.63 
 
 		 716 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  47.49 
 
 		 716 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  47.28 
 
 		 704 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  48.08 
 
 		 779 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  45.68 
 
 		 755 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 720 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  46.46 
 
 		 717 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 		 757 aa  602  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  49.02 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 758 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.23 
 
 		 755 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  46.82 
 
 		 714 aa  596  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  46.88 
 
 		 719 aa  595  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 758 aa  596  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  46.96 
 
 		 717 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  46.59 
 
 		 717 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  47.56 
 
 		 729 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  44.89 
 
 		 738 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.74 
 
 		 738 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  46.81 
 
 		 717 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  44.77 
 
 		 727 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  47.87 
 
 		 721 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  45.33 
 
 		 1464 aa  588  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  44.77 
 
 		 727 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.18 
 
 		 723 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  45.64 
 
 		 745 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  43.56 
 
 		 706 aa  582  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  45.89 
 
 		 712 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  45.59 
 
 		 719 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  45 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.73 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  45.51 
 
 		 701 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 		 711 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 		 711 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  44.63 
 
 		 766 aa  569  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.73 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  44.63 
 
 		 766 aa  569  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  45.26 
 
 		 754 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  48.2 
 
 		 708 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  45.06 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  46.34 
 
 		 692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  44.01 
 
 		 692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.81 
 
 		 715 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  43.9 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  44.77 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 		 739 aa  562  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  44.76 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  44.62 
 
 		 739 aa  562  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  45.16 
 
 		 722 aa  563  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.99 
 
 		 720 aa  563  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 845 aa  563  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  47.24 
 
 		 708 aa  562  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  48.12 
 
 		 705 aa  559  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  47.82 
 
 		 705 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  47.82 
 
 		 705 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  48.42 
 
 		 708 aa  556  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  46.03 
 
 		 695 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  48.93 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  45.48 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  45.68 
 
 		 702 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  46.39 
 
 		 743 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  47.05 
 
 		 688 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  47.21 
 
 		 688 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  45.17 
 
 		 704 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  47.5 
 
 		 712 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  45.63 
 
 		 691 aa  549  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  48.2 
 
 		 704 aa  549  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 712 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.26 
 
 		 721 aa  549  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  48.2 
 
 		 704 aa  550  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  43.36 
 
 		 750 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  43.95 
 
 		 733 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  42.9 
 
 		 716 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  43.58 
 
 		 704 aa  546  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  47.01 
 
 		 727 aa  546  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  46.42 
 
 		 712 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  44.78 
 
 		 737 aa  546  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.497261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  43.39 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  43.7 
 
 		 728 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  45.2 
 
 		 706 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 717 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  45.13 
 
 		 704 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  43.39 
 
 		 733 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  43.99 
 
 		 707 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  40.73 
 
 		 726 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  44.44 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  42.92 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  42.92 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  46.25 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  45.07 
 
 		 702 aa  539  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>