241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6971 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6971  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 407 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6944  hypothetical protein  27.79 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0027  OmpA/MotB domain protein  30.39 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  35.87 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 228 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 200 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 231 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 248 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  29.57 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.17 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 222 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.66 
 
 		 223 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 178 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.61 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  27.59 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.04 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.89 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 204 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.7 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.7 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.79 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 216 aa  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 		 207 aa  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  30.6 
 
 		 229 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  37.63 
 
 		 221 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.26 
 
 		 334 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.47 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  38.2 
 
 		 163 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1992  OmpA family protein  32.14 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.96 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  33.33 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  43.42 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.65 
 
 		 199 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  33.62 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.18 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.4 
 
 		 630 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.43 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  29.85 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  36.14 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  34.07 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  29.86 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 200 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 217 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  25.77 
 
 		 199 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  35 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  36.96 
 
 		 223 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  36.56 
 
 		 230 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  32.29 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  40.86 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  34.38 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  32.29 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  35 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  30.65 
 
 		 217 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>