70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2528 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2528  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
535 aa  1091    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.08 
 
 
810 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
878 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
748 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
762 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 
632 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
313 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
1276 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
700 aa  57  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 
927 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.27 
 
 
340 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
931 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
643 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.17 
 
 
561 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 
206 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1421 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
923 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
556 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.17 
 
 
561 aa  50.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 
614 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
3172 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  29.41 
 
 
538 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.95 
 
 
725 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
879 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
486 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
718 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.11 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.36 
 
 
795 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
792 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 
2240 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
589 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
505 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.06 
 
 
1000 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  22.26 
 
 
579 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
566 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
827 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  28.4 
 
 
389 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
522 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
248 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
1069 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
4079 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  23.78 
 
 
309 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.24 
 
 
979 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 
629 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
1038 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
1737 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 
689 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
739 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  28.11 
 
 
929 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
207 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
522 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
847 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 
1056 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
351 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.32 
 
 
277 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
729 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
364 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.75 
 
 
882 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
245 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.75 
 
 
882 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
697 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>