157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3029 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  51.87 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  49.74 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  37.87 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  36.17 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  36.09 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  36.09 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  36.09 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  38.24 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  34.59 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  34.29 
 
 		 238 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 365 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.5 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.96 
 
 		 954 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.17 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.91 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.1 
 
 		 1089 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1313  PAS sensor protein  30.69 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 1202 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1069 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 846 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3508  diguanylate cyclase  29.81 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00123099  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 897 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.36 
 
 		 958 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.96 
 
 		 728 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1191 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.5 
 
 		 1070 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 1215 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  30.48 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 1237 aa  52  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  29.22 
 
 		 730 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 		 866 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1300 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 728 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 1808 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 732 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.05 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 688 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  25.93 
 
 		 685 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 1432 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.26 
 
 		 1258 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1596 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 764 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 		 924 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 930 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1047 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  32.88 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1566  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.69 
 
 		 483 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  28.93 
 
 		 338 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  27.18 
 
 		 1099 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1669 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  28.85 
 
 		 956 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.28 
 
 		 872 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 		 953 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 733 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  27.7 
 
 		 1969 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3287  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.06 
 
 		 1003 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  32.93 
 
 		 1225 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  27.62 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1225 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4878  PAS fold-3 domain protein  32.88 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.72 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6278  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.88 
 
 		 1064 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.719663  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 547 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  47.27 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 		 865 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 998 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 1118 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0491  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.81 
 
 		 814 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 3706 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  27.18 
 
 		 711 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 699 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1046  putative diguanylate cyclase  25.55 
 
 		 559 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.25674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.32 
 
 		 705 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5111  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.79 
 
 		 163 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.77 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1501 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  43.64 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.69 
 
 		 1278 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 1273 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 987 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1116 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 		 572 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 2693 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  44.07 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1124 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1330 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 645 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.95 
 
 		 673 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>