78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3293 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 235 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  31.36 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  32.75 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  30.69 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.21 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  34.18 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  28.65 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  28.66 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  52.83 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.56 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.06 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  40 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.11 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  47.83 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  40 
 
 		 256 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  49.02 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.02 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1313  PAS sensor protein  28.95 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.94 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.65 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 704 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.11 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.94 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  44.68 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  44.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 1099 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.89 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  24.61 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.65 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.29 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.06 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 		 253 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 		 253 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 		 253 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  40.38 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  40 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  41.3 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.3 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.1 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 945 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.67 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.86 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.82 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.3 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 954 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.55 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.67 
 
 		 421 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.08 
 
 		 1089 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  32.2 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.17 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  37.25 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 1669 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1708  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.88 
 
 		 431 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.12 
 
 		 446 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 266 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.13 
 
 		 196 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.3 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.3 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5239  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 92 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5327  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 92 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.264881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1860  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 340 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>