106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.56 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  34.39 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.08 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.79 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.8 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.76 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.68 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.95 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.52 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.19 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.19 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.19 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.53 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  36.17 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.62 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.62 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.62 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  33.05 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.56 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  34.98 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.11 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  34.65 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.8 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.97 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.87 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.08 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.19 
 
 		 302 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.66 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  32 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  31.28 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.46 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  30.99 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  30.99 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.8 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.34 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.23 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.27 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.03 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.02 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.41 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.72 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.84 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.28 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.05 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.14 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.18 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  27.83 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.6 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.24 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.63 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  27.57 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.55 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.96 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.08 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.39 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.03 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.91 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.83 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.83 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.32 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  26.42 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  27.98 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  26.04 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.18 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.52 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.7 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  25.53 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  26.63 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  26.85 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  26.32 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.71 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  31.53 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.48 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.83 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.33 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.67 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.45 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.38 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.75 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.89 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  47.73 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  43.75 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.75 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  38.18 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  38.57 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  23.74 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>