88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0328 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.23 
 
 
245 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  46.52 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.67 
 
 
247 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  39.83 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  38.11 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.68 
 
 
250 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.57 
 
 
243 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.97 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.63 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  39.83 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.9 
 
 
330 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  38.91 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.82 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.63 
 
 
241 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.81 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.97 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.39 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.22 
 
 
268 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.15 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.91 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  32.24 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  35.93 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.35 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.11 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.61 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.63 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.22 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.11 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.3 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  27.22 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.81 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.81 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.41 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.32 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.45 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.81 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  28.82 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  31.87 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  28.32 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  28.32 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.05 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.28 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.16 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.82 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  29.79 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.5 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.19 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  27.75 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  29.83 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.28 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.51 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  29.7 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.38 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.38 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.38 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  28.66 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.81 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.04 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.92 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.79 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.78 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.78 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  27.96 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.81 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  27.68 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.12 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  25.64 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.08 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.33 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.62 
 
 
249 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.31 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.31 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  24.02 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.16 
 
 
243 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  26.45 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.55 
 
 
254 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.27 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.61 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 
229 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.09 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5327  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.94 
 
 
92 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.264881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5239  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.94 
 
 
92 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  26.18 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.69 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>