100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1049 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  74.21 
 
 
260 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.06 
 
 
249 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.06 
 
 
249 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  60.64 
 
 
236 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.36 
 
 
248 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  39.6 
 
 
252 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.89 
 
 
237 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  43.11 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  40.82 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.41 
 
 
258 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.46 
 
 
237 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  35.87 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  36.68 
 
 
235 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  37.93 
 
 
239 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.47 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  38.33 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.04 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  34.52 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.15 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  35.15 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.58 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.8 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.8 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.14 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  32.72 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.67 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.03 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  30.45 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  29.73 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.55 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.43 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.19 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  27.1 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  27.57 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.96 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.25 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  31.07 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  31.07 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.95 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  29.11 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.41 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.16 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.54 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.76 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.03 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.6 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  29.67 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.99 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  33.75 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.7 
 
 
302 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.16 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.68 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  30.53 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  26.86 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.73 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  34.92 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.6 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.79 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.06 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.19 
 
 
637 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.88 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  34.78 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.4 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.83 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.34 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.68 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.84 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.65 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  28.65 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  38.14 
 
 
396 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.12 
 
 
254 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  21.03 
 
 
554 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  27.23 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  27.23 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  26.26 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  28.17 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  25 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.15 
 
 
270 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.47 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  26.21 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.85 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  27.1 
 
 
705 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 
417 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.27 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1445  transcriptional regulator NifA  27.11 
 
 
572 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
1029 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>