147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0293 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  57.09 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  34.31 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.74 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.13 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  28.21 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.77 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.48 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.31 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.62 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  32.3 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.03 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.81 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.6 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.63 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.21 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.69 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.25 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.65 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.58 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.73 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.76 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.1 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  27.57 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.91 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.87 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.05 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.27 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.85 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.49 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.89 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.75 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.49 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.49 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.86 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.33 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  23.45 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.82 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.46 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.83 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.52 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.93 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  27.44 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.68 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  28.19 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  26.71 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  28.4 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.88 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.89 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.17 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  27.16 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  27.33 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.21 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.37 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  30.91 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  29.17 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  26.42 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  29.48 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.8 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.05 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.24 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  26.63 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.06 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  30.95 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.56 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.43 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.64 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.83 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.62 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.29 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.83 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.56 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.1 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.1 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.64 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  29.63 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.06 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.6 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  41.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.09 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  40.32 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.28 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  45.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  42.11 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>