292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4227 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  91.75 
 
 		 194 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  86.08 
 
 		 194 aa  346  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  78.76 
 
 		 196 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.36 
 
 		 221 aa  268  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.4 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.1 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  60.94 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  60.31 
 
 		 196 aa  247  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  61.34 
 
 		 195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  57.29 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  55.73 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.25 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  55.73 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.32 
 
 		 195 aa  224  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  57.14 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.26 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  55.26 
 
 		 195 aa  220  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.5 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  51.03 
 
 		 194 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.26 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.79 
 
 		 193 aa  197  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.78 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  42.63 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.02 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.62 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.06 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  39.68 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.7 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.7 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  40.74 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  40.74 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  40.44 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  39.68 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.21 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.15 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  43.27 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  38.62 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  39.68 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.69 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.68 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  39.68 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.79 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.68 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.68 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.03 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.37 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  38.42 
 
 		 214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  38.76 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.17 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.14 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.52 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.52 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.26 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3768  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.04 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.88 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  41.33 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  40.67 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.69 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.65 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  28.57 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.68 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.05 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.09 
 
 		 430 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.28 
 
 		 383 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.22 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.32 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.55 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.69 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  30.95 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.18 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.97 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  27.42 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.23 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.75 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.8 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2590  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  27.62 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.62 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.04 
 
 		 243 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.12 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.88 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  23.63 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.75 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>