134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0416 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  45.53 
 
 
245 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.57 
 
 
247 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.91 
 
 
255 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  39.83 
 
 
246 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.32 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.68 
 
 
245 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  40.5 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.76 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  32.19 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.45 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.04 
 
 
288 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.83 
 
 
242 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.22 
 
 
268 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
417 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.24 
 
 
330 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.11 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.59 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  34.5 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.75 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  34.88 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.46 
 
 
243 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  34.57 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.02 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.09 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.09 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  33.88 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.52 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.1 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  33.51 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  30.77 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.36 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  31.71 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.72 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.72 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.95 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.72 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.65 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.48 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  30.41 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  32.04 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.25 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.82 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.52 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.26 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  32.24 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.36 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  30.8 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  27.6 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.78 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.78 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.78 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.76 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.36 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.79 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  33.9 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.71 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  34.5 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.12 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.07 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.65 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.65 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.04 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.63 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.93 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  25.43 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.1 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.31 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.29 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  29.02 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  30.37 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  40.34 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.94 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.09 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.49 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
1224 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
1301 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.11 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.11 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  29.41 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  28.49 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.74 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.41 
 
 
1629 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  38.27 
 
 
207 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  38.27 
 
 
207 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  38.27 
 
 
235 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 
1126 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.45 
 
 
777 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3932  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.45 
 
 
1135 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  30.88 
 
 
494 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  30.88 
 
 
494 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
1135 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>