146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3633 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.95 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.28 
 
 
270 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.91 
 
 
260 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.63 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.88 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  33.49 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  35.51 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.49 
 
 
242 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.16 
 
 
279 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.45 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.4 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.19 
 
 
244 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  34.76 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  38.1 
 
 
246 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  36.32 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  36.32 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  38.86 
 
 
232 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.51 
 
 
243 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.02 
 
 
268 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.31 
 
 
268 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.28 
 
 
243 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.41 
 
 
246 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.21 
 
 
245 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.52 
 
 
228 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.26 
 
 
266 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.41 
 
 
266 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.61 
 
 
250 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.89 
 
 
236 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.87 
 
 
227 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.87 
 
 
227 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.87 
 
 
227 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.62 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.62 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  35.41 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.65 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.63 
 
 
245 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.98 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  32.56 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.55 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.73 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.6 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  34.43 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.74 
 
 
243 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.76 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  37 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.27 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.98 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 
417 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.42 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  32.39 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.72 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  36.63 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  32.8 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.06 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.21 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  31.86 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.07 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  32.64 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.72 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.44 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.26 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.32 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.84 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.1 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.1 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.49 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  30.67 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  31.02 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.68 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.86 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.87 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.82 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.34 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.46 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.85 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  29.33 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  33.33 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  32.32 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  29.7 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.34 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.34 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  35.05 
 
 
1629 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  29.34 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  29.93 
 
 
234 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
1135 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
987 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  30.7 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.41 
 
 
564 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.71 
 
 
1480 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 
447 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.300583 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>