116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0831 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  38.49 
 
 
248 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.44 
 
 
245 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.63 
 
 
249 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  40.54 
 
 
246 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.22 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.36 
 
 
250 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.64 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.94 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.46 
 
 
302 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.12 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.65 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.65 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  35.29 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  37.62 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.56 
 
 
235 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.16 
 
 
256 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  37.91 
 
 
225 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.48 
 
 
242 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.4 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.46 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.54 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 
227 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 
227 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 
227 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.24 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.72 
 
 
254 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  35.55 
 
 
259 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  36.87 
 
 
240 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  35.55 
 
 
264 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.56 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.87 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.55 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.26 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.94 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.13 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.86 
 
 
276 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.67 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.2 
 
 
265 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.98 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.36 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.57 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.48 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  30.45 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.27 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.88 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.41 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  27.98 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.03 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.14 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.39 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  29.69 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.43 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.78 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.82 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.82 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  32.6 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.49 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  28.42 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  34.05 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.29 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.12 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.94 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  32.02 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.16 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.59 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.07 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.38 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  28.05 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  27.23 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  26.76 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.02 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  33.97 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.11 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.11 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.4 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  27.06 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  26.32 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.06 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  28.82 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  51.06 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  27 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  27 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  27 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  26.61 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  45.65 
 
 
203 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5111  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.29 
 
 
163 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  29.55 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  50 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>