100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0513 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  83.81 
 
 
255 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.28 
 
 
247 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  45.06 
 
 
245 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.78 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  43.29 
 
 
246 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.32 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.29 
 
 
243 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  39.39 
 
 
248 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.63 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  39.3 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  35.66 
 
 
244 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.91 
 
 
241 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.44 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.18 
 
 
268 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.92 
 
 
244 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  31.22 
 
 
295 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.21 
 
 
242 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.36 
 
 
268 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.29 
 
 
270 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  39.02 
 
 
246 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.98 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.77 
 
 
330 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.16 
 
 
249 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.53 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.52 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.43 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.61 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.04 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.36 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.74 
 
 
253 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.74 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.74 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.03 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  28.95 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  28.95 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.12 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  28.85 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.36 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.19 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  31.09 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.44 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.27 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  31.19 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.16 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.16 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  29.28 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  29.36 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  34.62 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.76 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.71 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  27.55 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.87 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.55 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.16 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  25.97 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.55 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.64 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  28 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.84 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  27.06 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  25.78 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.96 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.83 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  38.82 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  27.68 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  35.42 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  36.47 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  36.47 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.71 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  35.42 
 
 
207 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.98 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.03 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  25.62 
 
 
249 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 
249 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.14 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.91 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  25.7 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.7 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1494  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.06 
 
 
769 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314319  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  25.45 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  29.25 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.58 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.51 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2632  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.41 
 
 
768 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.930318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  25.93 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
662 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
874 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  30.25 
 
 
396 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
773 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>