178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4299 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  63.91 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  35.93 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.55 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.59 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.97 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.22 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.22 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.22 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  36.97 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.12 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.57 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  35.68 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.75 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.89 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  41.5 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.04 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.04 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.04 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.27 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.11 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.36 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.56 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.24 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.91 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.82 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.44 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  37.04 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.31 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.29 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.81 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  35.61 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.59 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.07 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  37 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.27 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.36 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.98 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  34.26 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  34.09 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.78 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.16 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.14 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.55 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.55 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.48 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  37.25 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.72 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.64 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  36.88 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.09 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  36.36 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.95 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.14 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.14 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  34.97 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  32.6 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.12 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  35.98 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.3 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  34.94 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  33.13 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.93 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.46 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  30.77 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.46 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  34.13 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.09 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.34 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.99 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.78 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  33.53 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.48 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.89 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  30.17 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  31.74 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  30.3 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  48.08 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.89 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.78 
 
 		 195 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.78 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  44.78 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  32.75 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  51.85 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  30.29 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  31.22 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.58 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.35 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44 
 
 		 196 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  51.11 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  42.42 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.33 
 
 		 464 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.14 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2735  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.81 
 
 		 429 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0721448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>