126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0199 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.85 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.79 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.93 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  49.49 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.84 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  42.15 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.87 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.87 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.87 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  40.28 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.89 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.43 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.43 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.95 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.89 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.1 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.61 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.91 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  34.42 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.06 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.44 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  40.09 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.11 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  34.65 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.29 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.27 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.5 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.63 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  35.68 
 
 		 245 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.5 
 
 		 265 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.86 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.71 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.67 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.68 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  33.5 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  33.5 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.32 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.75 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.95 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.63 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.32 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.32 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.76 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.49 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 		 417 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  33.55 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.1 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.52 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.71 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.53 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.9 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  35.15 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.53 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.47 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.9 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  35 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.39 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  30.5 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  27.01 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.12 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.12 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.23 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.23 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  29.56 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.67 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.28 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.38 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.73 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.89 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  34.78 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  29.06 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.05 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  27.67 
 
 		 260 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.58 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  31.08 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  27.1 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  30.41 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  39.02 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  39.02 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  35.85 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.82 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.37 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.32 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  25.85 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  27.06 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  29.38 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  27.67 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  49.02 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.1 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  34.67 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.16 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  42.62 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>