121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2311 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  58.45 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.81 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  48.64 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  49.12 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.01 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.18 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.18 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.18 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.24 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  37.5 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.2 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  40.1 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  40.83 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.7 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.85 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.99 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.99 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.99 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.36 
 
 		 235 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.63 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.84 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  36 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.14 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  38.12 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  34.08 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.75 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.61 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.12 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.05 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.79 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.06 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.56 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.55 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.26 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.61 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  34.31 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  34.31 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  37 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.9 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.13 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.34 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.31 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.85 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.85 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.12 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.21 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.9 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.61 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.33 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  28.77 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  30.43 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  29.55 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.18 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.91 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  29.28 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  31.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.73 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  30.95 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.55 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.55 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  28.99 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  29.41 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.61 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  33.33 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  28.49 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  30.56 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.41 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.28 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.51 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.47 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.95 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  29.19 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  36.28 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  52.83 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.09 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  31.69 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  29.05 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  36.54 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  36.54 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.7 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  27.88 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  31.47 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 911 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  28.88 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  31.48 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3428  ANTAR domain protein  44.26 
 
 		 93 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  30.77 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.38 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 880 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5239  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.98 
 
 		 92 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5327  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.98 
 
 		 92 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.264881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  28.77 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  31.49 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>