65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2297 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  89.02 
 
 		 251 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.75 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  30.32 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  28.72 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.7 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.26 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.11 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  31.74 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.26 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.26 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.06 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.35 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.34 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.58 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.89 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.75 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.64 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.99 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  27.15 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.57 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.94 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.4 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.19 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.88 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.19 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.89 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.89 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.33 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.47 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.07 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  25.45 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.24 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  34.54 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  27.36 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.01 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.65 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.61 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.6 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.54 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  23.53 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.94 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.77 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.06 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  24.15 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  27.48 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  24.15 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.64 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  30.41 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  25.77 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.52 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  25.37 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.45 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.39 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.75 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.88 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  33.12 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.69 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  27.16 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3134  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.65 
 
 		 772 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>