147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2152 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.35 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.35 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  41.53 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  41.53 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.71 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.38 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.29 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  39.56 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.61 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.33 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.61 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.76 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.46 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.59 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.19 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.21 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.62 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.09 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.78 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.92 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.26 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  35.59 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.63 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.82 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  32.67 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.86 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  34.11 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.13 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.05 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  32.11 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.42 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.31 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  34.95 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.19 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  32.2 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  31.25 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.46 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.46 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.46 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.52 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.39 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.31 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.09 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  32.72 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.29 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.57 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.46 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.45 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.45 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  29 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.45 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.7 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  34.76 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.48 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.16 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.39 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.3 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  28.44 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  29.09 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.68 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.96 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  31.12 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.52 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  31.03 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  27.85 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  27.59 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  30.24 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.8 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.25 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.05 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.05 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  29.61 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  32 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.61 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.91 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.91 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  25.94 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  26.37 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  25.73 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  26.13 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  26.13 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.46 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.9 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  26.54 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  41.43 
 
 		 340 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  40 
 
 		 162 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.2 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  29.51 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.48 
 
 		 817 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>