122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2006 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  62.27 
 
 		 302 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  50.81 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  49.33 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  40.57 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  40.93 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.32 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  37.83 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.67 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.67 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.67 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.63 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.3 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.67 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.61 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  38.5 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.39 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  37.79 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.33 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.33 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.33 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.56 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.68 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.7 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.73 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.98 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.11 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.47 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.55 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.33 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  32.51 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.33 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.56 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.46 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.53 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  32.02 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.92 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.7 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.62 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.33 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.95 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.79 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.59 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.16 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.66 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.13 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  33.7 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  34.88 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  34.54 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.6 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.67 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  30.99 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.76 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.14 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  34.55 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.14 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.14 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  30 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.19 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  33.15 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.18 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.09 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.69 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  29.06 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.69 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  31.43 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.75 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.12 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.31 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  28.96 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  28.16 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  28.76 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  28.24 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.11 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.65 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.62 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.75 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  34.21 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  28 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  55.56 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  25.65 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  56.25 
 
 		 365 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.41 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  32.61 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  32.61 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.21 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  25.27 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  31.9 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  25.27 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  57.78 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  57.78 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  57.78 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  43.1 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>