46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0382 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 
330 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.86 
 
 
242 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.58 
 
 
243 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.9 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  38.19 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 
247 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  31.25 
 
 
232 aa  99  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  31.51 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.24 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.1 
 
 
255 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.77 
 
 
260 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  28.3 
 
 
246 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  31.5 
 
 
248 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.34 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.82 
 
 
241 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  27 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.4 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.64 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  29.08 
 
 
417 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  23.92 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  26.06 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  50.79 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  50.79 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.9 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.67 
 
 
246 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.63 
 
 
242 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  27.27 
 
 
246 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.51 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.22 
 
 
236 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.29 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.51 
 
 
245 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.29 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.09 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.14 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.62 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  30 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  25.86 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.18 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  27.47 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5111  ANTAR domain protein with unknown sensor  35 
 
 
163 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.17 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>