108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3173 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  55.56 
 
 
243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.86 
 
 
245 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.52 
 
 
245 aa  194  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  41.63 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.52 
 
 
247 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  40.52 
 
 
246 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.66 
 
 
260 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.37 
 
 
330 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.5 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  36.64 
 
 
232 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 
250 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.23 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.14 
 
 
268 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.56 
 
 
241 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.14 
 
 
242 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.39 
 
 
266 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.52 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.72 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  32.07 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.79 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.43 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.17 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  29.19 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  29.19 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.59 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  30.91 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.76 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  28.31 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.05 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  28.31 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.32 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.89 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.18 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.63 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.15 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.46 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  28 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  29.3 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.16 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  24.46 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.84 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.18 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.84 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.84 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.95 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.28 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.68 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.69 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.66 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  29.19 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.78 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.48 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.11 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.84 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  29.1 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  28.51 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.14 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.52 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.61 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  28.49 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  27.36 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.96 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.49 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.56 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  26.06 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.56 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  26.27 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  31.46 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.79 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  26.21 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.65 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  25.3 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  26.34 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.32 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  26.42 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.24 
 
 
249 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.48 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  27.71 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  31.82 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  31.82 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  31.82 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  24.76 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
776 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.7 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.7 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  31.13 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.44 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 
812 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  32.29 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
604 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>