42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1117 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  47.86 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  45 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  38.67 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  35.83 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  30.09 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  33.18 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0955  hypothetical protein  38.14 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.695061  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  29.77 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  32.69 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  32.69 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  30.74 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  27.41 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.67 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  32.29 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  29.57 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.93 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.21 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.4 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.25 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  28.95 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  30.85 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.4 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.44 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  28.79 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.44 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.39 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  28.17 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  34.62 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  26.86 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  38.71 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.25 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.45 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.7 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.25 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  26.58 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.69 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.87 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.95 
 
 		 268 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.94 
 
 		 236 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>