28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2469 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  65.45 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  47.86 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  41.77 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  39.29 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  32.23 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  34.95 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  34.95 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  31.78 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  34.33 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0955  hypothetical protein  36.07 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.695061  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  31.73 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.4 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  31.84 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.91 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.36 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  28.11 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.48 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.04 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  28.46 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.7 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.44 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  22.44 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.04 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.01 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.14 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.1 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>