131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3800 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.68 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  47.83 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  46.4 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  47.11 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.09 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.99 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.99 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.12 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  42.2 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  41.89 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.53 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  34.56 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.18 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  31.88 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.98 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  30.13 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.53 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  28.41 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.44 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.74 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  32.89 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  35.85 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  35.85 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.22 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.22 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.22 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  28 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  25.76 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.55 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.73 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.63 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.63 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.51 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  29.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.79 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  30.39 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.72 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  26.18 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.54 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.72 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.93 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.16 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.07 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.48 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  25.66 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.25 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.75 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.9 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  31.46 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  30.2 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  30.2 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.61 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  29.11 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.9 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.69 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.37 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.45 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  29.31 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.04 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  27.75 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.22 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.11 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.98 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.04 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.69 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.65 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.98 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.46 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 666 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  21.08 
 
 		 681 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  28.05 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  25.82 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.45 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.82 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  26.23 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.78 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  27.47 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  25.29 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.88 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  29.94 
 
 		 637 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 656 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  25.66 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.84 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.84 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 357 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 574 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 571 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>