121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5205 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  57.09 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  38.66 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.02 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.97 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.5 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.65 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  30.38 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.54 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  29 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  35.16 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.91 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.43 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.43 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.11 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.84 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.08 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.63 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.9 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.58 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.54 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.96 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  34.91 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.75 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.94 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.71 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.45 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.73 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  28.75 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.7 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  31.1 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.44 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.81 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  31.71 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.82 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.66 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  29.96 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  30.94 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.07 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.49 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.45 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.76 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  30 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.37 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.56 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.56 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.56 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  30.33 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.06 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.77 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.82 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.18 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.18 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.12 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.44 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  29.14 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  29.14 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.15 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.8 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  26.83 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.84 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.02 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.2 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.11 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.34 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  42.11 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.99 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.12 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  28.22 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  26.19 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.43 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  29.48 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.93 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.65 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.28 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.65 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.52 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.52 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  36.84 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.9 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.17 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  28.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.43 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2326  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.81 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.36 
 
 		 427 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  28.43 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  39.66 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.3 
 
 		 464 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.36 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 193 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>