89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5619 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
236 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  94.78 
 
 
249 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  94.78 
 
 
249 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  63.41 
 
 
260 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  60.64 
 
 
252 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.28 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  42.61 
 
 
252 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  44 
 
 
255 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  44.89 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.53 
 
 
237 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.56 
 
 
237 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.99 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  32.52 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  34.48 
 
 
274 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  34 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  29.21 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.54 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  34.34 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.81 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  34.64 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.15 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.14 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.15 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  33.49 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.38 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  28.34 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.23 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  30.62 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  28.32 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  31.9 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  30.8 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.1 
 
 
279 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.64 
 
 
256 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.95 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.65 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.95 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  32.65 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.72 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.08 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.63 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.57 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.57 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.9 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  30.32 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.1 
 
 
266 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  29.35 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  28.8 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.18 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  28.3 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.46 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.34 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  29.07 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.7 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  29.15 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.84 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  29.07 
 
 
259 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.09 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.74 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  28.93 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  30.29 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  30.29 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  27.68 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.92 
 
 
162 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.49 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  25 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.09 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.6 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.55 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.54 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.28 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  26.95 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0933  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.4 
 
 
456 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  24.11 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  38.18 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  26.94 
 
 
251 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>