40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4493 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  38.67 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  41.26 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  41.67 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  41.77 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  37.17 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0955  hypothetical protein  39.27 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.695061  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  29.11 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  32.04 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  32.87 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  29.69 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  29.22 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.18 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.18 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  33.01 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  33.01 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  31.88 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  31.14 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  28.83 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  27.6 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  30.53 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  29.73 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.15 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.82 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.25 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.18 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  27.63 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.83 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.83 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.13 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.56 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.71 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  29.91 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  32.14 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.52 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.79 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1807 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.73 
 
 		 246 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.73 
 
 		 246 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>