17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  33.02 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  28.64 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  29.36 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  28.77 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  28.18 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  28.1 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  29.02 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  27.36 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  27.36 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  29.73 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.73 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.7 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  46.94 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.98 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  27.7 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  27.64 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>