93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5329 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  77.78 
 
 
207 aa  318  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  73.3 
 
 
235 aa  277  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  42.03 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  38.94 
 
 
230 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  36.32 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  34.9 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  36.97 
 
 
274 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  32.5 
 
 
252 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.02 
 
 
248 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  36.22 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.21 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.2 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.55 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  32.52 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.92 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  31.34 
 
 
260 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  35.26 
 
 
246 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  29.95 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.2 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.2 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  34.13 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  33.81 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.04 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  46.58 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.91 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  28.77 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.15 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  27.55 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  30.65 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.73 
 
 
243 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.94 
 
 
255 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.05 
 
 
255 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.69 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.27 
 
 
249 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.54 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.73 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.13 
 
 
260 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.54 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.73 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.16 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.21 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.85 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  25.87 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.75 
 
 
265 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  25.73 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.13 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  27.23 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  32.1 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.79 
 
 
262 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  29.57 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.62 
 
 
228 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.38 
 
 
245 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.51 
 
 
270 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.82 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.82 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.35 
 
 
276 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.71 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.4 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.69 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.43 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.33 
 
 
637 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.4 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.26 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.07 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  26.15 
 
 
248 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  28.77 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  26.34 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  23.58 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  26.46 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  26.34 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.37 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.49 
 
 
265 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  31.63 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  29.59 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  29.52 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.56 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
417 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.18 
 
 
253 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  31.62 
 
 
251 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.81 
 
 
162 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>