133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3170 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.64 
 
 
250 aa  208  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.64 
 
 
302 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.06 
 
 
246 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.57 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  40.65 
 
 
251 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.8 
 
 
253 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.8 
 
 
253 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.8 
 
 
253 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.81 
 
 
256 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  38.79 
 
 
248 aa  151  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.6 
 
 
228 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.99 
 
 
227 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.99 
 
 
227 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.86 
 
 
228 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.99 
 
 
227 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.11 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  40.28 
 
 
225 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.78 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.43 
 
 
236 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.94 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.93 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.36 
 
 
243 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  39.38 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.29 
 
 
235 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.56 
 
 
244 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  34.39 
 
 
240 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.59 
 
 
265 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.19 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.98 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.91 
 
 
249 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.1 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.74 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  34 
 
 
259 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  34.3 
 
 
264 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.48 
 
 
268 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.28 
 
 
270 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.14 
 
 
279 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.41 
 
 
255 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.2 
 
 
245 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.02 
 
 
260 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.48 
 
 
254 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.88 
 
 
233 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.35 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.95 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  32.26 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  32.85 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.42 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.52 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.91 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.9 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.9 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  33.71 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.57 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.57 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.24 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.52 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  31.67 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  32.07 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.73 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  28.49 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.39 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.38 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  31.76 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  31.71 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.75 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.56 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.56 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.15 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  26.01 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.85 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  27.41 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.25 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.82 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  27.18 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  27.18 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  27.18 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  25.79 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  29.63 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  27.54 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  25.11 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  27.32 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.3 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.37 
 
 
499 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  25.39 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.27 
 
 
330 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.35 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3428  ANTAR domain protein  50.98 
 
 
93 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  26.79 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  27.32 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  34.29 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  30.5 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>