22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3068 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  487  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  42.98 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  41.67 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  39.58 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  33.48 
 
 		 274 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  33.66 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  29.05 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  28.84 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  31.43 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  26.24 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  29.82 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  28.36 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  28.36 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.33 
 
 		 637 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  28.5 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0955  hypothetical protein  35.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.695061  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  27.14 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.17 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  29.63 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.46 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.14 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>