38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2787 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  65.45 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  45.34 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  41.59 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  33.49 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0955  hypothetical protein  38.68 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.695061  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  32.49 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  35.52 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  35.52 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  32.84 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  32.31 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  32.89 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  32.5 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  29.78 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  34.92 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  31.84 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.47 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  32.89 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  29.69 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  25.22 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.88 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.64 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.28 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.48 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.56 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.7 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.56 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.56 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.88 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  46.94 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.02 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  25.56 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.99 
 
 		 233 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.88 
 
 		 244 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.67 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>