126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3463 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.28 
 
 
260 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  52.12 
 
 
255 aa  255  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  47.74 
 
 
245 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  44.78 
 
 
246 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.57 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.57 
 
 
250 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.51 
 
 
243 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.67 
 
 
245 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  40.52 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  40.43 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  41.1 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.95 
 
 
241 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.46 
 
 
279 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.24 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.74 
 
 
330 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.92 
 
 
268 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.77 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.03 
 
 
268 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.11 
 
 
288 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.5 
 
 
242 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.68 
 
 
235 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.65 
 
 
262 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.43 
 
 
245 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.17 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.17 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.17 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  30.83 
 
 
295 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  31 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.03 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.95 
 
 
249 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.92 
 
 
246 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.98 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  30.7 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 
417 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  32.91 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  32.29 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.68 
 
 
266 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.45 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  28.89 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  34.97 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  32.42 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  27.9 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.56 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.12 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  28.12 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.32 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.25 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.98 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.04 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  26.03 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.9 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.71 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.73 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.1 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.1 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.9 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.11 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.05 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  30.14 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.71 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  37.65 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.71 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  28.66 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  25.11 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.9 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.9 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  28.96 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  30.73 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  29.78 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.58 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.77 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.26 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.81 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.49 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.82 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  28.48 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  28.48 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.63 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  28.48 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.74 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.06 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.9 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.9 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  26.7 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  25.15 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  29.82 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  30.16 
 
 
396 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  24 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  37.33 
 
 
193 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  27.1 
 
 
233 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>